啟晴邨繼槍擊事件後，入伙僅僅兩年又出現另一問題：食水鉛含量超標，何謂多災多難。這次事故鬧得滿城風雨，令外界關注公屋的質量和食水安全等議題，矛頭更直指政府和中國建築。近年，香港政府不少部門的行政能力、行政效率、官員質素等等每況如下。各部門先後出現醜聞，而這次是房屋署和水務署。
水務署供水認可計劃失敗
水務署自2002年7月開始推行「大廈優質供水認可計劃－食水及沖廁水」。而這次主角──九龍城啟晴邨的六個樓宇，全都是獲水務署發出食水證書。計劃的檢驗中只是包括：鐵、PH值、色度、導電率、混濁度、埃希氏大腸桿菌和總大腸桿菌，並不包含抽驗鉛等對人有害的重金屬。
其實，這個供水認可計劃失敗早在幾年前就有先兆。在2012年，政府發新建成的政府總部中水管系統有「退伍軍人症」悍菌。當時，建築署署長梁冠基先生承認向承建商收樓時，是依足水務署的「優質食水認可計劃」抽驗水辦，堅稱該做法是完全符合國際的守則和標準。 由此可見，計劃檢驗的過於寬鬆，範圍應該擴大。計劃中的失敗已經不是單一的事件，化成全城熱點已有政總和啟晴邨兩宗，足以證明一個持續13年、花費不少公帑的供水認可計劃是失敗。經過此事後，市民對食水的安全只會要求更高，水務署宜重新審視認可計劃的成效。
房屋署管理和規劃失敗
房屋署是負責啟晴邨的管理和興建等事務。在啟晴邨入伙初期，居民曾委託民協檢驗約100個單位，發現有單位素質參差。附近不少的公共設施亦尚未完工，商埸都正在維修中，居住環境及生活素質低下。遺憾的是這批入伙居民已經比原定時間遲入伙三個月，入伙前後都諸多阻礙。在此已看出端倪：趕工完成的啟晴邨和房屋署監察不力，令啟晴邨出現極多設施問題鋪下了伏筆。
而這次食水含鉛事故，房署的表現更加是不堪入目。在入伙前，房署已經把關不力，沒有監管承建商的工程材料。在驗收屋邨時，房署又沒有發現水質問題。及後，啟晴邨的定期檢查和維護中，房署都沒有發現到水中的鉛含量超標。而事情發酵多日，房署應變能力差、透明度低、官員應對離譜，對承建商、事態發展、責任問題都交代不清。署長應耀康竟以「驚讀錯佢（承建商）個名」為理由，拒絕回應誰是承建商的提問。
無論事件的前後，房署的表現已經有目共睹。一個耗資17億港元的啟晴邨，有胡錦濤視察的新興公共屋宇，竟然發生如此多的問題和事故，不論在管理、規劃和事故應對上，房屋署都是責無旁貸。